More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0039 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0082  tRNA-Ala  98.28 
 
 		 76 bp  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0003  tRNA-Ala  98.28 
 
 		 76 bp  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0009  tRNA-Ala  98.28 
 
 		 76 bp  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0049  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0057  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00765372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0049  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0006  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4552  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0068  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0081  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0038  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0072  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0023  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0018  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000251336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0054  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0019  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0061  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0040  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0004  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0037  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0058  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0043  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345633  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6552  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4580  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6555  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0056  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0047  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t37  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00721336  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0041  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0636835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0072  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.01367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0010  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0035  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0025  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.156326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0003  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.070805  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0030  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.915184  normal  0.110132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA10  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0037  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0066  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00138372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0014  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0039  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.436106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0003  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000778688  normal  0.0120453 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna51  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000980823  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0027  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0013  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0119522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0044  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.541664  hitchhiker  0.000000158432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0089  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139487  normal  0.187722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0013  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0036  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0032  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0119257  normal  0.670174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0009  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000731062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0072  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0045  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0008  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0425989  normal  0.0119872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna58  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000146437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0006  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0860739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0011  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.193139  normal  0.133058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0033  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0013  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0084  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000245479  normal  0.337418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0057  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0965803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0009  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0037  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0014  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0034  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000978021  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA18  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0041  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0709552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0052  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3541  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000166638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00330  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00103294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00265908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1475  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000234459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3560  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1910  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000831958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0006  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0055  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0151112  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0042  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0776895  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0027  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0072  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000111766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0082  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0003  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000376598  normal  0.235119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0009  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275815  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0014  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.55572e-16  normal  0.0217689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0010  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.021677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0068  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0015  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>