More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_R0039 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0965803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.436106  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t37  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00721336  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0057  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00765372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0004  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0072  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0018  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000251336  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0033  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0013  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0066  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00138372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0027  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0070  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.756512  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0012  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0056  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0020  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0058  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0047  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4552  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0038  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0056  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0049  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0040  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6552  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4580  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6555  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0030  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.915184  normal  0.110132 
 
 
-
 
NC_003295  RS05584  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00134136  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0011  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.620126  normal  0.156635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0028  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101563  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0063  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0060  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1896  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000338005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0050  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0006  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118096  hitchhiker  0.00000272915 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00265908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000179192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000191328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3770  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000042375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3541  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000166638  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0051  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0061  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210957  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0072  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00338762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0080  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0573035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0011  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3567  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488975  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0496  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554193  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0086  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000211919  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0017  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000773583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0027  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000717749  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0073  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000273408  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0003  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137148  normal  0.888294 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0005  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000294423  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1989  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000370393  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0905  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00645915  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2045  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1098  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000248852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2896  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000192555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3093  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502528  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0004  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000214056  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0004  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  normal  0.758397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0055  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0151112  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0042  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0776895  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0027  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0072  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000111766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0082  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0016  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1169  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000639478  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0009  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000573658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0019  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000594786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0065  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0082  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000696423  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0088  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0003  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000305721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0006  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0040  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0018  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3107  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538271  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0009  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000350208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0018  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000940712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0063  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000409772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0079  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000825474  normal  0.0444964 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0084  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0103479  hitchhiker  0.00836377 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0452  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000943072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3542  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00175783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0700  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0927  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000140839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>