More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR_t32 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t37  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00721336  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0033  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0066  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00138372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0013  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0056  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0020  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0012  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0027  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0070  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.756512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0008  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0425989  normal  0.0119872 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0009  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000731062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0084  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000245479  normal  0.337418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0041  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0709552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0003  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000778688  normal  0.0120453 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0089  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139487  normal  0.187722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna58  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000146437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna51  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000980823  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0006  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0860739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0011  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.193139  normal  0.133058 
 
 
-
 
NC_003295  RS05584  tRNA-Ile  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00134136  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_003295  RS05733  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746893  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_003296  RS05382  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151411  normal  0.0932844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.620126  normal  0.156635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000503883  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3107  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0016  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216953  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0060  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0063  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0005  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000294423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000350208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0063  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000409772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000940712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0053  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0417957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0084  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0103479  hitchhiker  0.00836377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101563  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000305721  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00103294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00265908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1989  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000370393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0051  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0061  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210957  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0072  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00338762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0080  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0573035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000177246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1339  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1475  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000234459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3560  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1910  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000831958  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0086  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000211919  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000773583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000717749  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0073  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000273408  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137148  normal  0.888294 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1169  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000639478  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118096  hitchhiker  0.00000272915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0079  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000825474  normal  0.0444964 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3567  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0700  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0905  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00645915  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1896  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3542  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00175783  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  normal  0.758397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0055  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0151112  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0776895  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0072  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000111766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0082  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000376598  normal  0.235119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275815  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0014  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.55572e-16  normal  0.0217689 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3541  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000166638  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0593  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00108095  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3770  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000042375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000131419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0062  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0072  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0130788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0077  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000753043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00088301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0053  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00546912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0064  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130202  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0073  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010324  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0085  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000573658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000594786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>