More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_R0079 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000243293  hitchhiker  0.00235308 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_R0081  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000215983  normal  0.0761236 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0016  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0079  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000825474  normal  0.0444964 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0084  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0103479  hitchhiker  0.00836377 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0005  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000294423  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0003  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000305721  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0083  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000138325  normal  0.683431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0063  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000409772  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000715595  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000940712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3107  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0082  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000696423  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1169  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000639478  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0927  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000140839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00103294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00265908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000179192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000191328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0067  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0125771  normal  0.986623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0074  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018375  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000350208  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0088  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_R0087  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173535  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000244639  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0452  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000943072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0003  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1475  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000234459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3560  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1910  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000831958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1989  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000370393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3542  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00175783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0700  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2045  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1098  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000248852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2896  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000192555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3093  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3541  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000166638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3770  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000042375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0593  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00108095  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1339  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3831  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3567  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000057135  normal  0.0179085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000348646  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0081  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000458352  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0065  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451304  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0065  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000014658  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590045  normal  0.413985 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_R0088  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000267621  normal  0.680096 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0496  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554193  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1896  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0905  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00645915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00088301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0053  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00546912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0064  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130202  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0073  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010324  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0085  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000573658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000594786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0065  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118515  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0086  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000211919  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0017  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000773583  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0027  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000717749  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0073  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000273408  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0003  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137148  normal  0.888294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0013  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0056  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0020  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0012  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0066  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00138372  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0027  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0070  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.756512  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0033  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0009  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000731062  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0041  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0709552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0006  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0860739  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0011  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.193139  normal  0.133058 
 
 
-
 
NC_003295  RS05584  tRNA-Ile  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00134136  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0040  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0006  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118096  hitchhiker  0.00000272915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0011  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.620126  normal  0.156635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0060  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0028  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101563  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0018  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0039  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000177246  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0004  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000214056  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0006  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0052  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000131419  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0062  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509078  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0072  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0130788  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0077  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000753043  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>