More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_R0032 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_R0026  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.697663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0027  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0020  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.712374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905085  normal  0.99602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176599  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.434197 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0029  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0042  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0027  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0066  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00138372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0033  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0046  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.22296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0013  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0019  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0041  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0047  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t37  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00721336  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0054  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0015    91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0053  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0020  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.844212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0063  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124606  normal  0.113199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0027  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285298  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0053  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.4871  normal  0.314649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0010  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.021677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0068  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0015  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0023  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0006  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0020  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0044  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0062  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0019  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0061  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0068  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0043  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0054  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0049  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0006  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0023  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0081  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0037  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00103294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00265908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000179192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000191328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3770  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000042375  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0003  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000305721  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0056  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0008  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.532547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0020  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0003  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1475  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000234459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3560  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1910  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000831958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0012  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2045  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1098  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000248852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2896  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000192555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3093  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502528  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0005  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000294423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3541  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000166638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0020  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.530354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0042  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.333285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0015  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0019  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0009  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000057135  normal  0.0179085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0065  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0019  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000594786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0065  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118515  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0088  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0009  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000350208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0018  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000940712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0063  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000409772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0079  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000825474  normal  0.0444964 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0084  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0103479  hitchhiker  0.00836377 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0021  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000715595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0074  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018375  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0067  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0125771  normal  0.986623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0006  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000243293  hitchhiker  0.00235308 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_R0081  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000215983  normal  0.0761236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>