More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_R0015 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_R0007  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0031  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.333285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.532547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0020  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.530354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0041  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0061  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.842258  normal  0.752535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0047  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0027  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285298  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0015    98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0053  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.4871  normal  0.314649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0053  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0020  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.844212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0063  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124606  normal  0.113199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0010  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.021677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0068  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0015  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0054  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0043  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0054  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0006  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0081  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0019  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0049  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0061  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0068  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0037  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0023  tRNA-Ala  97.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA18  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA10  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0072  tRNA-Ala  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0020  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0070  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.756512  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0056  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0006  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0020  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0044  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0062  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0012  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0023  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0041  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.239536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0038  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0041  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0709552  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0009  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000731062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0006  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0860739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0011  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.193139  normal  0.133058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0004  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0002  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0065  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0496  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0593  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00108095  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00103294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00265908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000179192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000191328  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0006  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000243293  hitchhiker  0.00235308 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0003  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1475  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000234459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3560  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1910  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000831958  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0012  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00270892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3567  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0009  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000057135  normal  0.0179085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2045  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1098  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000248852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2896  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000192555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3093  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0016  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0003  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000305721  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3107  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538271  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1169  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000639478  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0905  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00645915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0038  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00088301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0053  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00546912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0064  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130202  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0073  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010324  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0085  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0021  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000715595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0067  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0125771  normal  0.986623 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3542  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00175783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0452  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000943072  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1896  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000338005  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_R0081  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000215983  normal  0.0761236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0009  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000573658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0019  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000594786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0065  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0082  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000696423  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0088  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0009  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000350208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0018  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000940712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>