299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_R0053 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0023  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.177577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  94.55 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0300  tRNA-Thr  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1890  tRNA-Thr  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0028  tRNA-Thr  89.86 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0418849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0050  tRNA-Thr  89.86 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130847  hitchhiker  0.00000000426742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0011  tRNA-Thr  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000345873  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0006  tRNA-Thr  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000177613  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R8  tRNA-Thr  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023394  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0092  tRNA-Thr  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000386697  hitchhiker  0.0000000672962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0024  tRNA-Thr  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0020  tRNA-Thr  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t02  tRNA-Thr  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246638  hitchhiker  0.000119939 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.88 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  93.88 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0264788  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  93.88 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5158  tRNA-Thr  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65124  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0027  tRNA-Thr  93.88 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00584174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0176  tRNA-Thr  93.88 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0417  tRNA-Thr  93.88 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00804447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna8  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0038  tRNA-Thr  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0041  tRNA-Thr  94.23 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0042  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000882152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4289  tRNA-Thr  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.11347e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4244  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127626  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0019  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000545792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0086  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0209186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0011  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t005  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t080  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t082  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t027  tRNA-Thr  93.75 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00943249  normal  0.0402241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0152  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000140276  hitchhiker  0.00000000136531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0029  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132706  normal  0.393089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0013  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000751402  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0044  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0022  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00933326  normal  0.943049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0112  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000415626  normal  0.792835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0006  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181943  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0041  tRNA-Thr  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0094  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00138001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0036  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.212017  normal  0.456319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0069  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.489026  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0103  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000466787  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0891  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0006  tRNA-Thr  95.45 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0019  tRNA-Thr  95.45 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000210733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0013  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0031  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000122273  normal  0.278033 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0110  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000430973  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0046  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451939  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0127  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000904299  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0088  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0412207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0156  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000748575  hitchhiker  0.000108427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0046  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0012  tRNA-Thr  94.23 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0077  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362174  hitchhiker  0.0000000000991776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0007  tRNA-Thr  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227553  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0092  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000157949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0015  tRNA-Thr  92.31 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101097  hitchhiker  0.004712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0004  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000250718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0103  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000642659  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0024  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151608  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2799  tRNA-Thr  86.84 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000124978  normal  0.096994 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1446  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00029205  normal  0.742429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0133  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000500666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t007  tRNA-Thr  93.75 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000938468  normal  0.123199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0005  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000832804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0013  tRNA-Thr  94.23 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0033  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000977619  normal  0.440974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0012  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000230734  normal  0.0248915 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0050  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789364  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0052  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000085939  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0012  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000866174  hitchhiker  0.00954127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0051  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0041266  normal  0.480692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0053  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0101  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000191032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0009  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0113  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0423055  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0010  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000391547  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58710  tRNA-Thr  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0410722  normal  0.504047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t029  tRNA-Thr  93.75 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00426722  normal  0.039681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0019  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.979216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  88.89 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0012  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013609  normal  0.0833663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0049  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00847785  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0051  tRNA-Thr  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00673114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>