43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_R0030 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_R0030  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.981752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0015  tRNA-Lys  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0017  tRNA-Lys  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.674136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4329  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0043  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0503955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0042  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0003  tRNA-Lys  91.49 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000250623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA25  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0028  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  89.58 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0058  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0022  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0054  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0048  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.219077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0020  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0036  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.415695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0018  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.46927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0031  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0048271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0035  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.367362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0035  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0989882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0021  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0042  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158394  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0006  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0055  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0855859  hitchhiker  0.00187773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0031  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0043725  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1973  hypothetical protein  93.75 
 
 		 318 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0041  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0001  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.46268e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0730  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0039  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474012  normal  0.0104027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>