299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0054 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0008  tRNA-Lys  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0599  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2342  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04002  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000208325  normal  0.100759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0013  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00193967  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0076  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  normal  0.566101 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0140  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0076  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41661  normal  0.163514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0010  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0012  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0061328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0013  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0641793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0338  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12303  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2817  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510108  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0034  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0010  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00296143  hitchhiker  0.00854354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0014  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717707 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0083  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456541  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0120  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0033  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0148  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530718  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0040  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0002  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.099087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0017  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143613  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0071  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0421157  hitchhiker  0.003467 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2266  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0017  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0018  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000139962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0020  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0050  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00633493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0028  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000473663  hitchhiker  0.000687264 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0073  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576385  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0040  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0076  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000822229  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0026  tRNA-Lys  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0039  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0029  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.395178  hitchhiker  0.000010783 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R35  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0039  tRNA-Asn  97.22 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000227587  normal  0.0269838 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0001  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0002  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0104  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0062  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.100557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0063  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.109202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04831  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0015  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0006  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276121  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0004  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.912706  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0048  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0043  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0523959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0051  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.022056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0019  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0045  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000363633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0022  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0035  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01380  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0844385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2866  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000326187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2868  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000077985  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04000  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000234259  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2778  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2777  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0039  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000683779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0067  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0031  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2933  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1695  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000039183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0052  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000077031  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0058  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161243  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0059  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000863176  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0053  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146858  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0041  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.0000000000000766368  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2877  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000083016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2815  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000000687096  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0039  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.480095  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0049  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0033  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0034  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000129233  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0031  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000000420525  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0032  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000000399959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>