67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3149 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1850  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00244712  hitchhiker  0.00000000792688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3149  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000320663  hitchhiker  0.0000000000372776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2610  tRNA-Met  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297612  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2412  tRNA-Met  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00869744  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1601  tRNA-Met  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1265  tRNA-Met  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1165  tRNA-Met  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1177  tRNA-Met  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105973  hitchhiker  0.000000000000145149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3536  tRNA-Met  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00370417  hitchhiker  0.000000304392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2193  tRNA-Met  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427584  hitchhiker  0.000000134605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3218  tRNA-Met  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.409054  hitchhiker  0.0091644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2909  tRNA-Met  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000128307  hitchhiker  0.0000000000424074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5028  tRNA-Met  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1768  tRNA-Met  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000113481  hitchhiker  0.00809166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2264  tRNA-Met  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.716137  hitchhiker  0.00000000422113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2796  tRNA-Met  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.466564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1863  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000158589  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0668  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2777  tRNA-Met  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379753  normal  0.476878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3898  tRNA-Met  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1167  tRNA-Arg  96.88 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.394373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3534  tRNA-Arg  96.88 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00384418  hitchhiker  0.000000731088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.617808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1603  tRNA-Arg  96.88 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2907  tRNA-Arg  96.88 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000134829  hitchhiker  0.0000000000437097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2498  tRNA-Arg  96.88 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  87.27 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0007  tRNA-Met  90.2 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0615  tRNA-Met  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.294067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0012  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097362  normal  0.0784713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0007  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  87.27 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  87.27 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3515  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  87.27 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3216  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.415947  hitchhiker  0.00933438 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1769  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000113481  normal  0.0122655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2262  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54251  hitchhiker  0.00000000419015 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0045  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0033  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0072  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0079  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0501725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2126  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0054  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121819  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60110  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24870  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  85.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>