78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0284 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0284  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.359801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0298  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0073  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0026  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0072  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000258619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0026  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477919  normal  0.0674918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4645  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5010  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0084  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806179  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0202  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0364  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0365  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000585486 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0373  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0664005  normal  0.64583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0358  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00005  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0355  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.170525  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0071  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0289  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.514684  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0020  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0070  tRNA-Thr  94 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0045  tRNA-Thr  88.57 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0031  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0799224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01506  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna8  tRNA-Thr  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222238  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0040  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0920487  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0031  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0547169  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0040  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0031  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0055  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5011  tRNA-OTHER  93.48 
 
 
80 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0033  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.531493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0039  tRNA-Thr  89.66 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000122131  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0014  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0215661  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0011  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0710124  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0030  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0191215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0053  tRNA-Thr  85.51 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  88.46 
 
 
73 bp  56  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0043  tRNA-Thr  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0062  tRNA-Thr  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269971  normal  0.0642327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0034  tRNA-Thr  84.29 
 
 
76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0992  tRNA-Thr  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0014  tRNA-Thr  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732279  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1602  tRNA-Thr  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0036  tRNA-Thr  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.212017  normal  0.456319 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3032  tRNA-Thr  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0058  tRNA-Thr  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2927  tRNA-Thr  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2989  tRNA-Thr  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.920581  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0155  tRNA-Thr  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2621  tRNA-Thr  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0778487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0031  tRNA-Thr  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t16  tRNA-Thr  85.71 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0026  tRNA-Thr  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0072  tRNA-Thr  85.71 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0753  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0540995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1598  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050926  normal  0.567134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0033  tRNA-Thr  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.389622  normal  0.782985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00918758  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0633  tRNA-Met  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.00000000739177  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0035  tRNA-Thr  88.1 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189489  normal  0.0273224 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1097  tRNA-Met  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0033  tRNA-Val  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0031  tRNA-Thr  88.1 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0180347  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0009  tRNA-Met  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0037  tRNA-Met  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0123  tRNA-Arg  100 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.553606  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0080  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.833302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PGt41  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PGt40  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>