46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_R0057 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0054  tRNA-Thr  96.61 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0062  tRNA-Thr  96.61 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  95 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  95 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0051  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0016  tRNA-Thr  90 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121936  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0011  tRNA-Thr  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330038 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0052  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32560  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0059  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.442507 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0026  tRNA-Thr  95.35 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13480  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26520  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0019  tRNA-Thr  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0018  tRNA-Thr  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0011  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0033  tRNA-Thr  85.33 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.389622  normal  0.782985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0019  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna8  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222238  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0006  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0013  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0090  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000130806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0014  tRNA-Thr  85.07 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.133787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0052  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0015  tRNA-Thr  85.07 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0049  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528142  normal  0.775121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0043  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0048  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0048  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00108032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0025  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000414519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0013  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0024  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0085  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0082  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000900182  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0036  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.212017  normal  0.456319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>