90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0046 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0046  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0042  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0019  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000210733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0052  tRNA-Thr  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0006  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0035  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0451303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0074  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0075  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0026  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0008  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0978186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58710  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0410722  normal  0.504047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5158  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65124  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1890  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0300  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0041  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0047  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0896302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0025  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0025  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.287713  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0062  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0045  tRNA-Thr  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.146924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0007  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0059  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000197967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0040  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0802458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0064  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0049  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0012  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  84.13 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2625  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251255  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0020  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.569703  normal  0.360507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0048  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0051  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.697724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0066  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000021471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0024  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0025  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2626  hypothetical protein  96.15 
 
 		 1470 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000164664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0050  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000169071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0044  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0025  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0041  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0044  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0032  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0020  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0025  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.673297  hitchhiker  0.00231767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000000354338  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1375  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000019852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0058  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000348439  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0056  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305477  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0092  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000000431101  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0018  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.867463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0040  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2101  hypothetical protein  96.15 
 
 		 228 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000210975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2102  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000104727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0053  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3211  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000514426  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0013  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00152659  hitchhiker  0.00055755 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2486  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314441  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2540  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0000814865  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0029  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0993455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0045  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000205649  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0016  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0021  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178891  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0041  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1985  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000056627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0082  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000900182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0028  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000000054137  normal  0.608945 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0058  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.000000000000357472  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0022  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0058  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000000000613252  normal  0.244453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0028  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000102756  hitchhiker  0.00235863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>