229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_R0025 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.287713  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0025  tRNA-Thr  97.26 
 
 
76 bp  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0018  tRNA-Thr  97.26 
 
 
76 bp  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387982  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0002  tRNA-Thr  93.06 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0013  tRNA-Thr  90.41 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00152659  hitchhiker  0.00055755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0019  tRNA-Thr  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000210733  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0006  tRNA-Thr  92.98 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0023  tRNA-Thr  88.89 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.177577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0026  tRNA-Thr  92.59 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0249  tRNA-Thr  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1949  tRNA-Thr  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  93.75 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  90.74 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  97.56 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  91.67 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0020  tRNA-Thr  87.5 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.569703  normal  0.360507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0025  tRNA-Thr  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0062  tRNA-Thr  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0012  tRNA-Thr  93.62 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000302559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0055  tRNA-Thr  93.62 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6025  tRNA-Thr  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142522  normal  0.946345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0028  tRNA-Thr  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0087  tRNA-Thr  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0078  tRNA-Thr  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0015  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.446606 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07721  tRNA-Thr  95.24 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0040  tRNA-Thr  100 
 
 
72 bp  60  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0802458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  90 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0059  tRNA-Thr  94.74 
 
 
75 bp  60  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000197967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0020  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 
72 bp  60  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0012  tRNA-Thr  95.24 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0013  tRNA-Thr  95.24 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0041  tRNA-Thr  95.24 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0004  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.657407  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0042  tRNA-Thr  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0049  tRNA-Thr  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0046  tRNA-Lys  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144311  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0044  tRNA-Lys  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0030  tRNA-Lys  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00181999  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0020  tRNA-Lys  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0059  tRNA-Thr  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0049  tRNA-Thr  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA35  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.056149  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0014  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0079  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0077  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.435861  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0039  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0040  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0009  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.420581  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0040  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0027  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00574952  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0035  tRNA-Thr  89.58 
 
 
73 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0451303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0012  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  90.91 
 
 
73 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0040  tRNA-Thr  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238807  hitchhiker  0.0000185517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0074  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900217  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0001  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0025  tRNA-Thr  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102759  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0011  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.983753  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0034  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108602  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0077  tRNA-Thr  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362174  hitchhiker  0.0000000000991776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0003  tRNA-Met  88.14 
 
 
77 bp  54  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.879602  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0029  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0005  tRNA-Met  88.14 
 
 
77 bp  54  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00829837  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0358  tRNA-Thr  89.36 
 
 
73 bp  54  0.000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0055  tRNA-Thr  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00352038  hitchhiker  0.00739911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0038  tRNA-Thr  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.40901  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0046  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.856653  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0037  tRNA-Thr  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0045  tRNA-Thr  94.87 
 
 
75 bp  54  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.146924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0046  tRNA-Thr  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0016  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0037  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205438  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0064  tRNA-Thr  96.67 
 
 
76 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>