299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_R0042 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_R0042  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0052  tRNA-Thr  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0059  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0028  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6025  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142522  normal  0.946345 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0087  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0078  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.204281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0049  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0249  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1949  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000845493  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0020  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0018  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0025  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0035  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0034  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0046  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t02  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246638  hitchhiker  0.000119939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0092  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000386697  hitchhiker  0.0000000672962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R8  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023394  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0011  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000345873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0006  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000177613  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0020  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.569703  normal  0.360507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00074  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000415552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0003  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000427431  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000032371  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03604  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03598  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1179  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960939  hitchhiker  0.000000000000835142 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0109  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000358604  hitchhiker  0.0022661 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4717  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.16021e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03606  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5100  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5033  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.631552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4351  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000576988  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0005  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000149688  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4505  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000183891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna094  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000050133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4470  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000595919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0006  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03595  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0005  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00198851  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna103  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000044405  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0084  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr02  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4424  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165207  hitchhiker  0.0000465726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4473  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000034435  hitchhiker  0.00000000000000876352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4548  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000034857  hitchhiker  0.00000000000110779 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5441  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000104819  hitchhiker  0.00042936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna048  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000703931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna096  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna100  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000040947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00237  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4383  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0011  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0488568  normal  0.109473 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0019  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000545792 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0002  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0069  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0053  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0011  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0662869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0891  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309270  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0019  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000210733  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0035  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0451303  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0088  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0412207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0103  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000466787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4289  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.11347e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4244  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5029  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0086  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0209186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0004  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000250718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0103  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000642659  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0006  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181943  normal  0.0306111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>