299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1949 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1949  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0249  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0018  tRNA-Thr  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387982  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0025  tRNA-Thr  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0028  tRNA-Thr  94.44 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0087  tRNA-Thr  94.44 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0078  tRNA-Thr  94.44 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6025  tRNA-Thr  94.44 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142522  normal  0.946345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  95.83 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0035  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309270  tRNA-Thr  97.92 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0034  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0049  tRNA-Thr  97.67 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0042  tRNA-Thr  94.12 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  97.56 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0020  tRNA-Thr  97.56 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0059  tRNA-Thr  97.56 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0025  tRNA-Thr  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0019  tRNA-Thr  95.83 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0025  tRNA-Thr  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.287713  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309366  tRNA-Thr  95.83 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.983743  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309213  tRNA-Thr  95.83 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  93.75 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0002  tRNA-Thr  97.44 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0020  tRNA-Thr  97.62 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.569703  normal  0.360507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0069  tRNA-Thr  97.62 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t02  tRNA-Thr  91.84 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246638  hitchhiker  0.000119939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0092  tRNA-Thr  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000386697  hitchhiker  0.0000000672962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0077  tRNA-Thr  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362174  hitchhiker  0.0000000000991776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0006  tRNA-Thr  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000177613  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R8  tRNA-Thr  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023394  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0011  tRNA-Thr  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000345873  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  91.84 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0019  tRNA-Thr  91.67 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000545792 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0891  tRNA-Thr  91.67 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0053  tRNA-Thr  95.45 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0042  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0112  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000415626  normal  0.792835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0052  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0127  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000904299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4244  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000845493  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0094  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00138001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0092  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000157949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0086  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0209186  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0024  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151608  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0019  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.979216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t005  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t082  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0031  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000122273  normal  0.278033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0006  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181943  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0044  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550992  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0069  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.489026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t007  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000938468  normal  0.123199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0088  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0412207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2799  tRNA-Thr  90.2 
 
 
78 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000124978  normal  0.096994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0133  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000500666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0013  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406405  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0101  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000191032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0103  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000466787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0029  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132706  normal  0.393089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0005  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000832804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1446  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00029205  normal  0.742429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0004  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000250718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0103  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000642659  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0015  tRNA-Thr  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101097  hitchhiker  0.004712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0152  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000140276  hitchhiker  0.00000000136531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0012  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000230734  normal  0.0248915 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0050  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789364  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0052  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000085939  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0012  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000866174  hitchhiker  0.00954127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0051  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0041266  normal  0.480692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0053  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0009  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0113  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0423055  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4289  tRNA-Thr  90.2 
 
 
78 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.11347e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0156  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000748575  hitchhiker  0.000108427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0012  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013609  normal  0.0833663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0049  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00847785  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0051  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00673114  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0046  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451939  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0011  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0013  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000751402  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0010  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000391547  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0033  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000977619  normal  0.440974 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0110  tRNA-Thr  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000430973  normal  0.778481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>