251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0013 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00152659  hitchhiker  0.00055755 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0025  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.287713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0025  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0019  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000210733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0025  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0018  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0033  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258005  decreased coverage  0.00480976 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0019  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000545792 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0026  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0891  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0003  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.879602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0006  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0005  tRNA-Met  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00829837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0049  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0035  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0451303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0054  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4332  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0047  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0896302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0066  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000415256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0068  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000142194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0084  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0062  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0036  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.212017  normal  0.456319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0051  tRNA-Met  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.430637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0025  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0035  tRNA-Thr  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189489  normal  0.0273224 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0049  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0058  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0409  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000026925  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0031  tRNA-Thr  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0180347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0014  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1949  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01506  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000845493  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0026  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.1113400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2989  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.920581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0020  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0031  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3032  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0039  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000122131  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0023  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.177577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1602  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57437  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0249  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0031  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0547169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0040  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0920487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0011  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0710124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0014  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0215661  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0041  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0155  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0031  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0799224  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0050  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130847  hitchhiker  0.00000000426742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0062  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269971  normal  0.0642327 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0030  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0191215  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0055  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2927  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0040  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2621  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0778487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0028  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0418849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0058  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0992  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00074  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000415552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4505  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000183891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0109  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000358604  hitchhiker  0.0022661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03598  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0033  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.531493  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00237  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4473  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000034435  hitchhiker  0.00000000000000876352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0084  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1179  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960939  hitchhiker  0.000000000000835142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03604  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03595  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0364  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000032371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4424  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165207  hitchhiker  0.0000465726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0202  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0023  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>