216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0009 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0019  tRNA-Thr  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0018  tRNA-Thr  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04020  tRNA-Thr  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.730789  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0029  tRNA-Thr  93.1 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0730  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03660  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.018948  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt24  tRNA-Thr  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0080  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0022  tRNA-Ala  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000459218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162323  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0048  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00108032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0025  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000414519  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt05  tRNA-Ala  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000322453 
 
 
-
 
NC_002950  PGt30  tRNA-Ala  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt36  tRNA-Ala  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1579  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1614  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.614815 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0011  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.176514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0045  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000176076  normal  0.226339 
 
 
-
 
NC_002950  PGt45  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0010  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00600624  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0010  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000320815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0004  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000388071  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0025  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000411074  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna58  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000146437  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0004  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000194526  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0089  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139487  normal  0.187722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0084  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000245479  normal  0.337418 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0064  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna51  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000980823  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0008  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0425989  normal  0.0119872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0012  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458677 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0025  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0011  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0003  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000778688  normal  0.0120453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0085  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0032  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0045  tRNA-Ala  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0004  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171326  hitchhiker  0.00000000652292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0071  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0008  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00330  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05733  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746893  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t37  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00721336  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt023  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00025586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00103294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0051  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0061  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210957  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0011  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0039  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000177246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0003  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1475  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000234459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3560  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1910  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000831958  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0086  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000211919  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0017  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000773583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0027  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0072  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000111766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0082  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0003  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000376598  normal  0.235119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0052  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000131419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0062  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0072  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0130788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0077  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000753043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0038  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00088301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0053  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00546912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0064  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130202  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0073  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010324  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0085  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAla02  tRNA-Ala  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0006  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0860739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0011  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.193139  normal  0.133058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0009  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000573658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0019  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000594786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0050  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0003  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000305721  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0016  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1169  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000639478  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3107  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0006  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0018  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0040  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0005  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000294423  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1989  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000370393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3541  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000166638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3770  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000042375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0593  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00108095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>