More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0032 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0024  tRNA-Ala  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0197077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0080  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0009  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292395  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0033  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0049  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0047  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0038  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0058  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6555  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0040  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4552  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566095  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6552  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4580  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0056  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0012  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00270892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  88.41 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0034  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  88.41 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0046  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0004  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171326  hitchhiker  0.00000000652292 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t37  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00721336  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0030  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.915184  normal  0.110132 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0033  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0013  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0058  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.819419 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0033  tRNA-Val  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0332381  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0027  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0064  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.801657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0032  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0066  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00138372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05584  tRNA-Ile  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00134136  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0028  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101563  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0016  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0018  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0006  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0008  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000503883  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1989  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000370393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0006  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118096  hitchhiker  0.00000272915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0063  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0050  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00103294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00265908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000179192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000191328  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0005  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000294423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3107  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0031  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044944  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0011  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.620126  normal  0.156635 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0040  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0086  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000211919  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0017  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000773583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0027  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000717749  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0073  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000273408  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0003  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137148  normal  0.888294 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1339  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3567  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488975  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2045  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1098  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000248852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2896  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000192555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3093  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1169  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000639478  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0003  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000305721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0004  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  normal  0.758397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0055  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0151112  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0009  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000731062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0019  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000594786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0065  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0082  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000696423  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0088  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0593  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00108095  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0020  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  88.71 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0164  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.405268  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  88.71 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1707  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1834  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0009  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000350208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0018  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000940712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0063  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000409772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>