64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_R0033 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0332381  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0020  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320151  normal  0.0855025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14023  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0034  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0038  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0034789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0035  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0029  tRNA-Val  88.41 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0032  tRNA-Ala  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0031  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0024  tRNA-Val  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.422383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0058  tRNA-Val  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000337816  normal  0.447594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0074  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0744587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0059  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.40098  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688167  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0027  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.480715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0056  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0028  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.163089  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0002  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884588  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0050  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0019  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0953  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0049  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0008  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0024  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0020  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0058  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0052    100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t15  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0007  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0014  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.328994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00626142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0864  hypothetical protein  100 
 
 		 276 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0025  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0239971 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0036  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0015  tRNA-Val  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0394069 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-2  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.516841  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt01  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0012  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0007  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0174963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0048  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0187429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0043  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4574  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0200099  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0611  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0857734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA13  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00601929  normal  0.184013 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0039  tRNA-Val  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.910644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0044  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.306747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0041  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0014  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0045  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.374674 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0073  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0026  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1005  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0020  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0903  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>