21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_14023 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_14023  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0031  tRNA-Val  97.3 
 
 
75 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0034  tRNA-Val  95.95 
 
 
75 bp  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0030  tRNA-Val  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0027  tRNA-Val  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0027  tRNA-Val  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558731  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  87.84 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0047  tRNA-Val  94 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0033  tRNA-Val  87.84 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0332381  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0035  tRNA-Val  83.78 
 
 
75 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0039  tRNA-Val  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0020  tRNA-Val  85.96 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320151  normal  0.0855025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0012  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0007  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0174963 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Val-2  tRNA-Val  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0014  tRNA-Val  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.328994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0059  tRNA-Val  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412801  normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0036  tRNA-Val  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0090  tRNA-Val  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0089  tRNA-Val  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000177778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0072  tRNA-Val  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>