205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_R0041 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_R0041  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0027  tRNA-Val  97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.480715 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0953  tRNA-Val  97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0050  tRNA-Val  97.33 
 
 
75 bp  133  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t15  tRNA-Val  97.22 
 
 
72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0058  tRNA-Val  94.67 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0012  tRNA-Val  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0007  tRNA-Val  93.33 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0174963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0020  tRNA-Val  98.28 
 
 
72 bp  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0031  tRNA-Val  98.21 
 
 
75 bp  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432364  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt01  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0007  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0014  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194107  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4574  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0200099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0048  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0187429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0043  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0045  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.374674 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0008  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0039  tRNA-Val  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.910644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0044  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.306747  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0073  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0026  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113953  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0043  tRNA-Val  92.65 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0052    90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0033  tRNA-Val  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000112986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0056  tRNA-Val  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0046  tRNA-Val  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26227  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0049  tRNA-Val  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0020  tRNA-Val  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0611  tRNA-Val  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0857734  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0046  tRNA-Val  90.67 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03462  tRNA-Val  94.74 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000504437  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0033  tRNA-Val  94.74 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0005  tRNA-Val  91.3 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0005  tRNA-Val  91.3 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858584  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0007  tRNA-Val  91.3 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0032  tRNA-Val  94.74 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0035  tRNA-Val  94.74 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268717  normal  0.222107 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0028  tRNA-Val  94.74 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118191  normal  0.542965 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-2  tRNA-Val  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.516841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  94.64 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  91.18 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0024  tRNA-Val  89.33 
 
 
75 bp  85.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0016  tRNA-Val  91.8 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000321371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0053  tRNA-Val  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.694322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA13  tRNA-Val  89.86 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00601929  normal  0.184013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0062  tRNA-Val  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  89.71 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0019  tRNA-Val  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0002  tRNA-Val  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884588  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0046  tRNA-Val  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0028  tRNA-Val  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.163089  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0051  tRNA-Val  92.59 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000163002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0044  tRNA-Val  92.59 
 
 
72 bp  75.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0043  tRNA-Val  92.59 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172535  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  92.59 
 
 
72 bp  75.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  92.59 
 
 
72 bp  75.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0061  tRNA-Val  88.41 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0068  tRNA-Val  90.16 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.064456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0033  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675019  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  93.75 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  93.75 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1555  tRNA-Val  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0020  tRNA-Val  93.75 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0496105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0024  tRNA-Val  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.508678  normal  0.235406 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07570  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.10137  normal  0.977811 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  90.74 
 
 
72 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0054  tRNA-Val  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0048  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.546388  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0036  tRNA-Val  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.012717  normal  0.28653 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0040  tRNA-Val  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0038  tRNA-Val  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405817  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0052  tRNA-Val  90.57 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222044  normal  0.0244207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0032  tRNA-Val  90.57 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0039  tRNA-Val  89.47 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00107403  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0031  tRNA-Val  90.57 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0032  tRNA-Val  90.57 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44499  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0026  tRNA-Val  90.57 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00797883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0027  tRNA-Val  90.57 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0055  tRNA-Val  90.57 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0679296  normal  0.0243248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0054  tRNA-Val  90.57 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163017  normal  0.0248084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0053  tRNA-Val  90.57 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165796  normal  0.0236662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>