13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_R0031 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_R0031  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0034  tRNA-Val  98.67 
 
 
75 bp  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14023  tRNA-Val  97.3 
 
 
75 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0030  tRNA-Val  97.22 
 
 
72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0027  tRNA-Val  97.22 
 
 
72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0027  tRNA-Val  97.22 
 
 
72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558731  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0047  tRNA-Val  92 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0033  tRNA-Val  85.33 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0332381  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  85.14 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0040  tRNA-Val  83.78 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0051  tRNA-Val  83.78 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.223947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0040  tRNA-Val  83.78 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00410606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0039  tRNA-Val  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>