64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0024 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0024  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.422383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0038  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0034789  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10340  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0379292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0033  tRNA-Val  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0332381  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0036  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0013  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688167  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0074  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0744587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0013  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0059  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.40098  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0053  tRNA-Val  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000170226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA13  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00601929  normal  0.184013 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0045  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0252567  normal  0.0396614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0044  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0042  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279186  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1830  tRNA-Val  87.93 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.367633  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0168  tRNA-Val  87.93 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2150  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2949  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2946  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.411322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2943  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2626  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.888803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2440  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2629  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.8453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2632  tRNA-Val  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.602317  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0024  tRNA-Val  87.93 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0025  tRNA-Val  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0239971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0020  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0019  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0049  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0046  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0044  tRNA-Val  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0046  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0026  tRNA-Val  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000373011  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0052    93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0056  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0002  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884588  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0046  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0036  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0028  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.163089  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0007  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0004  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000770056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0052  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137415  normal  0.324257 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0051  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0014  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tVal01  tRNA-Val  88.1 
 
 		 81 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.231904  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0054  tRNA-Val  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0003  tRNA-Val  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0002  tRNA-Val  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0074  tRNA-Val  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0087  tRNA-Val  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0014  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0035  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0005  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0005  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna47  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>