288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0045 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0045  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0041  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0260276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0037  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.021593 
 
 
-
 
NC_002950  PGt05  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000322453 
 
 
-
 
NC_002950  PGt30  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt36  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0027  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.554328 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAla02  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0010  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.870532  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt45  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0016  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.367308  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07699  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.515536  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13664  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.235996  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0036  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0052  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.495975  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0654  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1372  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0045  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000176076  normal  0.226339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0047  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0013  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0447386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0053  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0059  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.455983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0053  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0069  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181592  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0047  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0017  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0003  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0024  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00249338  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0048  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00554369  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0079  tRNA-Ala  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0062  tRNA-Ala  92.45 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.128618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0052  tRNA-Ala  92.45 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00134949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0023  tRNA-Ala  92.45 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0034  tRNA-Ala  92.45 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0822071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0072  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.821542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0017  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0394632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0020  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.18478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0056  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0020  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0046  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0071  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0061  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0030  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0035  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-1  tRNA-Val  87.32 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000143563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-3  tRNA-Val  87.32 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0062  tRNA-Val  87.32 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0009  tRNA-Val  87.32 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000748453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0076  tRNA-Val  87.32 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0076  tRNA-Val  87.32 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0062  tRNA-Val  87.32 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0009  tRNA-Val  87.32 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000461705  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt40  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt41  tRNA-Val  92.86 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0060  tRNA-Val  89.66 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.206205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0006  tRNA-Val  90.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0019  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0023  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0032  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0061  tRNA-Val  89.66 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.304237  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0020  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0164  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.405268  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1707  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1834  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0062  tRNA-Val  89.66 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.296107  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-3  tRNA-Val  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00184226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0071  tRNA-Val  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-1  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-2  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00946418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-3  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-4  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-5  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt023  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00025586  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0046  tRNA-Val  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.461452  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0049  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000361087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0035  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0069  tRNA-Val  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000032502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0003  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0022  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0054  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0077  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1248  tRNA-Val  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.134542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0079  tRNA-Val  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.262586  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0556  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2175  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.527459  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2568  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0023  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0226385  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0172  tRNA-Val  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0005  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000213903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-2  tRNA-Val  85.92 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0092  tRNA-Val  88.14 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.825054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0277  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.5301700000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0010  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0003  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00134196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0005  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000781338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0011  tRNA-Val  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0091  tRNA-Val  88.14 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.830426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0090  tRNA-Val  88.14 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.825054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0080  tRNA-Ala  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>