More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0045 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_R0045  tRNA-Ala  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000176076  normal  0.226339 
 
 
-
 
NC_002950  PGt05  tRNA-Ala  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000322453 
 
 
-
 
NC_002950  PGt30  tRNA-Ala  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PGt36  tRNA-Ala  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0027  tRNA-Ala  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.554328 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAla02  tRNA-Ala  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_002950  PGt45  tRNA-Ala  94.59 
 
 
77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0047  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591987  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0017  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0047  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0053  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0036  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0003  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0053  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0013  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0447386  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0010  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.870532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0016  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.367308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0069  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0059  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.455983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0052  tRNA-Ala  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.495975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0004  tRNA-Ala  91.89 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108101  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0020  tRNA-Ala  91.89 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.71083e-16  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0029  tRNA-Ala  91.89 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000220959  unclonable  0.000000053075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0041  tRNA-Ala  91.89 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000493148  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0048  tRNA-Ala  90.54 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00554369  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0024  tRNA-Ala  90.54 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00249338  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0079  tRNA-Ala  90.54 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13664  tRNA-Ala  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.235996  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07699  tRNA-Ala  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.515536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0654  tRNA-Ala  90.54 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1372  tRNA-Ala  90.54 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0003  tRNA-Ala  93.44 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00134196  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0005  tRNA-Ala  93.44 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000781338  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0010  tRNA-Ala  93.44 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0005  tRNA-Ala  93.44 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000213903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0005  tRNA-Ala  93.44 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0004  tRNA-Ala  89.19 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171326  hitchhiker  0.00000000652292 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0045  tRNA-Ala  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0041  tRNA-Ala  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0260276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0037  tRNA-Ala  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.021593 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0020  tRNA-Ala  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0164  tRNA-Ala  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.405268  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1707  tRNA-Ala  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1834  tRNA-Ala  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0046  tRNA-Ala  95.56 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0010  tRNA-Ala  94.34 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.407573  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0058  tRNA-Ala  95.56 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.819419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0041  tRNA-Ala  91.8 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0004  tRNA-Ala  91.8 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.892843  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0032  tRNA-Ala  95.56 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0025  tRNA-Ala  94.34 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0005  tRNA-Ala  94.34 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0010  tRNA-Ala  94.34 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057492  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0064  tRNA-Ala  95.56 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.801657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0034  tRNA-Ala  95.56 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0005  tRNA-Ala  94.34 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314904 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0051  tRNA-Ala  94.34 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00326143  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0046  tRNA-Ala  94.34 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0258027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0011  tRNA-Ala  94.23 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454361  hitchhiker  0.00914283 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0050  tRNA-Ala  94.23 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.142623  normal  0.530513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0386  tRNA-Ala  94.23 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3082  tRNA-Ala  94.23 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0091  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387028 
 
 
-
 
NC_003295  RS00330  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00649993  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS05584  tRNA-Ile  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00134136  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_003296  RS05382  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151411  normal  0.0932844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0053  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0417957  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0051  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0061  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210957  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0072  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00338762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0080  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0573035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0011  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0380305  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0039  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000177246  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0015  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143157  hitchhiker  0.00508793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0010  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081559  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0032  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244606  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0063  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0073  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385296  hitchhiker  0.0000734054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0068  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000449242  hitchhiker  0.000000587301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0050  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112182  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0006  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0060  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0043  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0232966  normal  0.0867643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0003  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0034  tRNA-Ala  97.67 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0060  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000596545  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0011  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.620126  normal  0.156635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0004  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  normal  0.758397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0096  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493226 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0077  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000753043  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0040  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0018  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0028  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101563  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0062  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000193695  normal  0.338495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0013  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0442856  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0062  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000375232  hitchhiker  0.000000804387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0053  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000325055  normal  0.687052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0079  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  normal  0.0302308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0006  tRNA-Ala  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118096  hitchhiker  0.00000272915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>