43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_R0025 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt24  tRNA-Thr  98.21 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317233 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.22 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0047  tRNA-Thr  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0048  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0038  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.40901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0011  tRNA-Thr  86.57 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000646692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0006  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0001  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0015  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0004  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0108141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0046  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871205  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0012  tRNA-Thr  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0013  tRNA-Thr  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0041  tRNA-Thr  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0036  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0219325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0028  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0055  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0012  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000302559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0051  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00117786  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07721  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_830  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000571794  hitchhiker  0.0000531069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000141075  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0028  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0046  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195569  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0035    86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00887484  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0042  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0931  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA22  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0019  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0760  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07701  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t14  tRNA-Thr  85.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>