14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PGt24 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PGt24  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0025  tRNA-Thr  98.21 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0048  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0036  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0219325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0019  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0018  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0047  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0012  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000302559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0055  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0042  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>