49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0042 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0042  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1354  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0012  tRNA-Thr  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0048  tRNA-Thr  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0017  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0090775  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0004  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0008  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0009  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.317875 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0730  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0043  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0013  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0050  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0043  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478862  hitchhiker  0.000308471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0045  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0027  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0953414  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0012  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0044  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00954192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0033  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0003  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0072  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0057  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00765372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0018  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000251336  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0004  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0003  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0007  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0023  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0037  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0003  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.203261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0053  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0011  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0088  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA10  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA18  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000388071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt24  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0033  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna58  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000146437  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000320815  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000194526  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00600624  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0089  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139487  normal  0.187722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0084  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000245479  normal  0.337418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0425989  normal  0.0119872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000778688  normal  0.0120453 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna51  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000980823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>