49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_R0053 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_R0053  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0088  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0003  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0003  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.203261 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0003  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0008  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0037  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0004  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0009  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.317875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0011  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0047  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.424478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0048  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0048  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0050  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0035  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0890141  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0012  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0033  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0043  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.168441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna54  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0009  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0475152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0017  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0090775  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0061  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000697471  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0022  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000272434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0048  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000131085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0013  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261851  hitchhiker  0.00494296 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0042  tRNA-Thr  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1329  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60630  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831176  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0062  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0011  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0033  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.607965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0039  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395559  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0040  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000012917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0012  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0029  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0020  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.868603  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0436  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0044  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00954192  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0030  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0030  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1716  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000136572  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1469  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000598832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0018  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0351719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>