279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_R0048 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_R0048  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0037  tRNA-Thr  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0004  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0003  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0009  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.317875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0003  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.203261 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0003  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0088  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0008  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0035  tRNA-Thr  98.08 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0890141  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0053  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0043  tRNA-Thr  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.168441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0050  tRNA-Thr  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0048  tRNA-Thr  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0047  tRNA-Thr  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.424478 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna54  tRNA-Thr  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0011  tRNA-Thr  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0033  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0012  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458677 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1329  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0017  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0090775  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0001  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0009  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0475152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0042  tRNA-Thr  95 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0022  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000272434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0016  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000516971  normal  0.0942255 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0084  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000225446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0061  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000697471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0084  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0091  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000624593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2874  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.51003e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000845493  normal  0.021037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00074  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000415552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000032371  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna094  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000050133  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.607965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5441  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000104819  hitchhiker  0.00042936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4473  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000034435  hitchhiker  0.00000000000000876352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4548  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000034857  hitchhiker  0.00000000000110779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4383  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4470  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000595919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4351  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000576988  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115507  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna100  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000040947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr02  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna048  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000703931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna096  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0109  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000358604  hitchhiker  0.0022661 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0436  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4505  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000183891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1179  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960939  hitchhiker  0.000000000000835142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5100  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5033  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.631552  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4717  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.16021e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1716  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000136572  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1469  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000598832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna103  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000044405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0003  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000427431  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4424  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165207  hitchhiker  0.0000465726 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00237  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03598  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03606  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03595  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03604  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0029  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.403719 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478027  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0586  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177308  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2194  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000558715  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1676  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000911888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0013  tRNA-Thr  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261851  hitchhiker  0.00494296 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1108t  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0016  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000293232  hitchhiker  0.00358578 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0891  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0006  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3123t  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000529436  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0035  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0021  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160361  normal  0.0210498 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2230  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000875758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0014  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000764457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3120t  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000534878  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3193t  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0908668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3208t  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0023  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.234998  normal  0.014223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>