109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0048 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0048  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000131085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0029  tRNA-Thr  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0024  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0700552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0012  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0011  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0033  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0008  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0021  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0058  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478027  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0004  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0009  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.317875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0003  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.203261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0053  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0088  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0003  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4297  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.801361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0040  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0016  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.448611  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0007  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0032  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.386226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0007  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0005  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 155 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13110  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0488167  normal  0.646736 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0047  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.361519  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0020  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0183484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>