More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_60630 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_60630  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t02  tRNA-Thr  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246638  hitchhiker  0.000119939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0077  tRNA-Thr  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362174  hitchhiker  0.0000000000991776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0092  tRNA-Thr  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000386697  hitchhiker  0.0000000672962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0011  tRNA-Thr  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000345873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R8  tRNA-Thr  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023394  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0006  tRNA-Thr  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000177613  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 76 bp  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0040  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238807  hitchhiker  0.0000185517 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  94.03 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0024  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0112  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000415626  normal  0.792835 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0103  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000466787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4244  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t005  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t080  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t082  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0031  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000122273  normal  0.278033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0029  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132706  normal  0.393089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0005  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000832804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0069  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.489026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0156  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000748575  hitchhiker  0.000108427 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0127  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000904299  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0022  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00933326  normal  0.943049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0094  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00138001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0042  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0101  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000191032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4289  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 78 bp  97.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.11347e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0013  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000751402  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0046  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0110  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000430973  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t027  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00943249  normal  0.0402241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0092  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000157949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0004  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000250718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0103  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000642659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0019  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.979216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0006  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181943  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0152  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000140276  hitchhiker  0.00000000136531 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1446  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00029205  normal  0.742429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2799  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 78 bp  97.6  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000124978  normal  0.096994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t029  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00426722  normal  0.039681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0012  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000230734  normal  0.0248915 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0050  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0052  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000085939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0012  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000866174  hitchhiker  0.00954127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0051  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0041266  normal  0.480692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0053  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t007  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000938468  normal  0.123199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0009  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0113  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0423055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0012  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013609  normal  0.0833663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0049  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00847785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0051  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00673114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0133  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000500666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0010  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000391547  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0033  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000977619  normal  0.440974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0013  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0011  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0086  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0209186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0044  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0088  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0412207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0700  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0045  tRNA-Lys  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0379079  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00074  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000415552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4717  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.16021e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03604  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03595  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1179  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960939  hitchhiker  0.000000000000835142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5029  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03606  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00237  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5100  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03598  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0003  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000427431  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2874  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.51003e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000032371  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4470  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000595919 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5033  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.631552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4424  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165207  hitchhiker  0.0000465726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4351  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000576988  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4548  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000034857  hitchhiker  0.00000000000110779 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr02  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2036  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405552  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0824  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0733527  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4505  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000183891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>