283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0033 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0033  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0067  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0193127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0055  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.623624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0053  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0068  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0051  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0017  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0079  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000115444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2740  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000025557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1997  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4222  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.27944e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4221  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1995  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t070  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t072  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt28  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt28  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0077  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000406262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R32  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0075  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000128408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0078  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000423049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0062  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000778147  normal  0.022465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0064  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000617351  normal  0.0220533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0062  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000770874  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0064  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000015576  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0076  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000128408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0060  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000591053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0062  tRNA-Ala  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000152195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60510  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0025  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0004    92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.887473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0029  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA1  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.586426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0010  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0005  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0035  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00302352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0004  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0002  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.778996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0056  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0066  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0063  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.949581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0071  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60530  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0002  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23570  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981863  normal  0.0268964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0017  tRNA-Ala  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.238623  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0057  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0335757  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0046  tRNA-Ala  95.56 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.150337  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0033  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0034  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00040  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0035  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04531  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000151858  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0053  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0051  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0047  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000125219  normal  0.0337252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0050  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142107  normal  0.0152639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0027  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000168426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0030  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000620846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0044  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2625  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2626  hypothetical protein  90.2 
 
 		 1470 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000164664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0075  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2459  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0029  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0993455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2486  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0082  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150663  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1985  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000056627  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0079  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0088  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000415947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0035  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0016  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0045  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000205649  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0064  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.478576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0029  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000636082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0032  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000439194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0091  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000846369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0062  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0092  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000000431101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4679  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4680  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267016  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0056  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305477  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5047  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000162268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0049  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.661163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0087  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00553547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0089  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0027987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0091  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000134168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0093  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000010191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0098  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000110088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0018  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.867463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0040  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1300  hypothetical protein  90.2 
 
 		 147 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00987773  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1301  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00804048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2101  hypothetical protein  90.2 
 
 		 228 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000210975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2102  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000104727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0046  tRNA-Ala  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0265781  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0100  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335947  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0053  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3211  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000514426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>