29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_03660 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_03660  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.018948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04020  tRNA-Thr  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.730789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0019  tRNA-Thr  86.84 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0018  tRNA-Thr  86.84 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0012  tRNA-Thr  88.06 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0048  tRNA-Thr  90.91 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00108032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0025  tRNA-Thr  90.91 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000414519  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0091  tRNA-Thr  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0009  tRNA-Thr  85.53 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1354  tRNA-Thr  85.53 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0730  tRNA-Thr  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0031  tRNA-Thr  89.83 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000818386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0030  tRNA-Arg  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.474637  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24830  tRNA-Thr  86.67 
 
 
77 bp  56  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  87.27 
 
 
74 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0028  tRNA-Thr  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0013  tRNA-Thr  88.89 
 
 
73 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0051  tRNA-Thr  96.55 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0020  tRNA-Thr  87.5 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.868603  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0030  tRNA-Thr  87.5 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0030  tRNA-Thr  87.5 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582099  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0015  tRNA-Thr  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0044  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0059  tRNA-Thr  86.96 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000197967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>