158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0047 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0035  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0451303  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0442  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0006  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0001  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0015  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0057  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0004  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0108141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0028  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0053  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.702685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0005  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0017  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395224  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0055  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0059  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.442507 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13480  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4318  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0158  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0045  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0302111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0008  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0042  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna147  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna132  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna135  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000774984  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna143  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000903927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA52  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01238  tRNA-Met  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01240  tRNA-Met  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01243  tRNA-Met  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0011  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0085  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0053  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.914408  normal  0.310755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0011  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0027  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0028  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00544508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00010  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000107047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00014  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000132366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0061  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.9923400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0065  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0759  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000782067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0793  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00146175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0763  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000016187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0011  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0738  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000396563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0010  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0828  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000835761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0734  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0720  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0798  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00121297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0785  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000059431  normal  0.369596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0010  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0031  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629379  hitchhiker  0.000794999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0035  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000330461  hitchhiker  0.000751114 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1763  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000111546  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1771  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000741128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0832  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000791902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0066  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4650  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000849948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4654  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.94372e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5015  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000219916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5019  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000540299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0044  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000282394  normal  0.033686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0048  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000017739  normal  0.0157813 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0074  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000108683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0078  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0688  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0692  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000520696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0781  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000729773  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0012  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0724  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000898131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0388  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000012647  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0579  tRNA-Met  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000127758  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr03  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0052  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.058148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0024  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000548413  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0052  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0057  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.117051  hitchhiker  0.00489854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0031  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000818386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5648  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502297  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt07  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0002  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000184905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0010    90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0025  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0189  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0023  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165773  normal  0.561147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0013  tRNA-Thr  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0048  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.397818  normal  0.996159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0002  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5651  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000701056  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0001  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0054  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000720671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0168  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4555  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0780  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0034  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0016  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150249 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>