79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_tRNAThrVIMSS1309174 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309174  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309101  tRNA-Thr  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0037  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309133  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0019  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309213  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309366  tRNA-Thr  88.71 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.983743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0020  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.569703  normal  0.360507 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0044  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0001  tRNA-Thr  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309270  tRNA-Thr  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0092  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000386697  hitchhiker  0.0000000672962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0011  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000345873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0006  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000177613  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60630  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t02  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246638  hitchhiker  0.000119939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R8  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023394  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0006  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0053  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0001  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0048  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t45  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0002  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68150  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000338016  decreased coverage  0.00289129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0069  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5899  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0077  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362174  hitchhiker  0.0000000000991776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0001  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.200882  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr02  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.965954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr01  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.969246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0042  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0001  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3208t  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4383  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4548  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000034857  hitchhiker  0.00000000000110779 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3120t  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000534878  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna103  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000044405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3123t  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000529436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3193t  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0908668  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1108t  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna100  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000040947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna096  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5441  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000104819  hitchhiker  0.00042936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna094  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000050133  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 155 bp  44.1  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5100  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169748  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0005  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000149688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0005  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00198851  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna048  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000703931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03606  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0094  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr02  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0003  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000427431  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2867  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000032371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2869  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00237  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03595  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03598  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03604  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4351  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000576988  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4717  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.16021e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5033  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.631552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00074  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000415552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0072  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742395  normal  0.95428 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0109  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000358604  hitchhiker  0.0022661 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1179  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960939  hitchhiker  0.000000000000835142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4424  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165207  hitchhiker  0.0000465726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4505  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000183891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4473  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000034435  hitchhiker  0.00000000000000876352 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4470  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000595919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>