30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_R0037 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309101  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309174  tRNA-Thr  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309133  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0059  tRNA-Thr  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0044  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0019  tRNA-Thr  86.15 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309213  tRNA-Thr  86.15 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0020  tRNA-Thr  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.569703  normal  0.360507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0002  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309366  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.983743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0053  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0001  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0006  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0068  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000142194  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0700  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0012  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0001  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2036  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0670  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122631  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5029  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0004  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0005  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.570473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309270  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t45  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0048  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>