34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0068 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0068  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000142194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0033  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258005  decreased coverage  0.00480976 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0048  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t45  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0001  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0001  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.200882  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0001  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.486305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0001  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000737901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0001  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0017  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0020  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0013  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00152659  hitchhiker  0.00055755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0018  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0025  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0049  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0001  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0037  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0010  tRNA-Thr  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0043  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0006  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0069  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0001  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0044  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0025  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt14  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0081  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.757841  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lplt14  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>