21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0081 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_R0081  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0056  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00644368 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0058  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_870  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000136902  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000811018  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0028  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000277136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0148448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0057  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0014  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0041  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0043  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.757841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0070  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0046  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000132851  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0055  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000633202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0068  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000142194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0021  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0225545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>