More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0052 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0020  tRNA-Thr  93.06 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0017  tRNA-Thr  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0010  tRNA-Thr  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114274  hitchhiker  0.00000872087 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0021  tRNA-Thr  94.83 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0625627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0046  tRNA-Thr  94.83 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0468144  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0052  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA51  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0701295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0005  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0013  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0007  tRNA-Thr  93.22 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.237633  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0105  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288138  hitchhiker  0.0000019759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60040  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.909692  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0025  tRNA-Thr  95.65 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0037  tRNA-Thr  91.94 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  0.113649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0028  tRNA-Thr  91.94 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0032  tRNA-Thr  91.94 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08670  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482106  hitchhiker  0.000524894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0821  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0929777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t07  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000225857  unclonable  0.000000193462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0061  tRNA-Thr  92.98 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA67  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105718  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R87  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0043  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.757841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0019  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0144795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0016  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000237824  normal  0.0237533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0084  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000286992  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0037  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t04  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t07  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.222466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0030  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4335  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0007  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0038  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70785  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0005  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.63313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0275  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000205711  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0048  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.397818  normal  0.996159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0011  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137284  normal  0.0115711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0070  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000211747  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00332161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05587  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000149657  normal  0.0701364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0014  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116743  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0014  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000427945  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000416702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1905  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0012  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.11185e-23  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0071  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0072869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0034  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.952764  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0056  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0111608  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0069  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00993164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0061  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296073  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3795  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128346  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0047  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000841137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0022  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t10  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000121578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3763  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152532  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0012  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000200408  hitchhiker  0.00313302 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3825  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.366335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3085  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000338041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3460  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000610299  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0035  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0436953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0033  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0051  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0077  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000188112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0005  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0057  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0009  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238051  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0059  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0057  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145876  hitchhiker  0.000000719754 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0017  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000663854  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0039  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.103551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0048  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.623542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0016  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000825993  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0014  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000027785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0013  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000441208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3187  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000488058  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0005  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.134807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0008  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0054  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000720671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0044  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000154669  normal  0.0727135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0057  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0072  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.465958  hitchhiker  0.00803701 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0049  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0067  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.689375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0025  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0003  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00291494  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0005    91.23 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0031  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0975905  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0021  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0696816  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0005  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309299  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0668617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0015  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0027  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>