75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_R0018 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0053  tRNA-Met  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0051  tRNA-Met  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0072  tRNA-Met  98.61 
 
 		 73 bp  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.916606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0047  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.921613  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0016  tRNA-Met  98.63 
 
 		 77 bp  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0010  tRNA-Met  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0010  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159974  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0014  tRNA-Met  96.97 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0720319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03520  tRNA-Met  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0067  tRNA-Met  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268357  normal  0.588554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0051  tRNA-Met  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0068  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0052  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.959791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0010  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0053  tRNA-Met  90.48 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0022  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0016  tRNA-Met  91.07 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00509711  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0039  tRNA-Met  91.07 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067349  normal  0.10104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0028  tRNA-Met  91.07 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t30  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00107522  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0013  tRNA-Met  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-1  tRNA-Met  94.59 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0007  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1863  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000158589  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0668  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0049  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0021032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0008  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000331146  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0045  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0040  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000293258  hitchhiker  0.00175254 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  85.45 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0014  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000605229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0050  tRNA-Phe  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0036  tRNA-Phe  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0023  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000976194  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0034  tRNA-Phe  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  86.21 
 
 		 80 bp  44.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0014  tRNA-Met  83.78 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0467162  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0025  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0008  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14007  tRNA-Met  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0236309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0059  tRNA-Phe  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0052  tRNA-Phe  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.443748 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0056  tRNA-Phe  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0068  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000142194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>