298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lplt14 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lppt14  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt14  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0050  tRNA-Thr  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0049  tRNA-Thr  95.31 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0052  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R07  tRNA-Thr  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0054  tRNA-Thr  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0019  tRNA-Thr  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000545792 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0891  tRNA-Thr  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt014  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0018476  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0404  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0049  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt27  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.938992 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0016  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0020  tRNA-Thr  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0007  tRNA-Thr  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227553  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0249  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0038  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1949  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0023  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.051511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0022  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0060  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0060  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.845098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna43  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0037  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000058592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2046  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000370287  hitchhiker  0.00336958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0052  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0026  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0045  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315592  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0071  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0059  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0042  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4239  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00412423  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0034  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0024  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.226382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0006  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0019  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000210733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0025  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0061  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0035  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0017  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0018  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.489322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0014  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150145  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0015  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0016  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0485613 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1329  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_722  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0023  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.299591  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000148305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4659  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.951839999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0011  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00131891  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0766  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000107183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0073  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623521  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5024  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0069  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2557  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000373976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0458  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0666  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0583  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.0474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0768  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000959618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5022  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000229653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5020  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0067  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000904848  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0049  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309270  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0036  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000225732  normal  0.109866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0038  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000184687  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0039  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375421  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0040  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351036  normal  0.107458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0064  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000662129  normal  0.0840838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0771  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5023  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0071  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577417  normal  0.268649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0772  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0068  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000208772  normal  0.273161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>