16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07560 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07560  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.788241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0007  tRNA-Thr  91.78 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0050  tRNA-Thr  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0330794  normal  0.0472699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0056  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0016  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.230534  normal  0.905617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0007  tRNA-Thr  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0002  tRNA-Ala  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15370  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00052169  normal  0.0383592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0013  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162323  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0053  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000611222  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>