86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0042 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0042  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000217777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0014  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0014  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0017  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0025  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000025626  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0007  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00416188  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0016  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0049  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0006  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15370  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00052169  normal  0.0383592 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0006  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0035  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0064  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0047  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.67913  normal  0.0842935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0024  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0048  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000535442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0002  tRNA-Asn  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.823848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0022  tRNA-Thr  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000000830353  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0001  tRNA-Asn  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.432405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0036  tRNA-Lys  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0286926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0029  tRNA-Lys  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0006  tRNA-Thr  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00193537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0016  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.669511  normal  0.713856 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3670  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0054  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0013  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0047  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110384  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0016  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00244932  hitchhiker  0.00000298756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0056  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0068  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0055  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231554  normal  0.162704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0046  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.567197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00327  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0049  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0038  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3702  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0055  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0064  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0016  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000863002  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0015  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0017  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0075  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3261  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1810  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3645  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2743  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2972  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0059  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0024  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07721  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0048  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000384504  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0578  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0013  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000652832 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0051  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0052  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0025  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00179903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0024  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0023  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.909867  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14019  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.458455 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0051  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0052  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0740  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt025  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000274648  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000058592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>