67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_R0051 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0051  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0051  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0048  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  93.1 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  93.1 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0017  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0033  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0001  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.432405  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0002  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.823848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0013  tRNA-Asn  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00234115  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0042  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00104158  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0012  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571236  normal  0.0197692 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0049  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0053  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0280094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0023  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.909867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0025  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00179903  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0029  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.763657  normal  0.753454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0024  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.330999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0012  tRNA-Trp  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000299257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0037  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000296875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0012  tRNA-Trp  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000390892  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0005  tRNA-Lys  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0004  tRNA-Lys  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0053  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.157606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0047  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0059  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0084  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000101082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0057  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000258126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0042  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0064  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0065  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_R0081  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0008  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0010  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_R0080  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_R0082  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA27  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.841539  normal  0.0659835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0059  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  0.24905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0006  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0042  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000397698  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0003  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0019  tRNA-Asn  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0006  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0343832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0011  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000022551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0069  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0196822  normal  0.911508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0065  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0028  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0042  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000217777  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0048  tRNA-Asn  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00987914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_BR0015  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00932066  normal  0.140678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>