72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_R0068 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_AR0075  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0055  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231554  normal  0.162704 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0068  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS00327  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0055  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0054  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0016  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.669511  normal  0.713856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0046  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.567197 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2743  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3702  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0013  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3645  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1810  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3261  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0015  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0016  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000863002  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0016  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00244932  hitchhiker  0.00000298756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0056  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220185  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2972  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0049  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3670  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0024  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0086  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0076  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0079  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0065  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00709117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0038  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.40901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0091  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000624593  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0084  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000225446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2874  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.51003e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0045  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00898673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0024  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0046  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0036  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0286926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0042  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000217777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0029  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60630  tRNA-Thr  83.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>