More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A5804 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  98.68 
 
 
79 bp  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000810946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  97.26 
 
 
76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  97.26 
 
 
76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  97.26 
 
 
76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  97.26 
 
 
78 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  97.26 
 
 
78 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  97.26 
 
 
78 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  94.74 
 
 
155 bp  119  9.999999999999999e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  95.65 
 
 
76 bp  113  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0086  tRNA-Thr  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0110  tRNA-Thr  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0045  tRNA-Thr  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  96.83 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0065  tRNA-Thr  96.83 
 
 
73 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00709117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0076  tRNA-Thr  96.83 
 
 
73 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0079  tRNA-Thr  96.83 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  98.11 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.55 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478027  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  97.87 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  97.87 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  97.87 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  97.87 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  97.87 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  97.87 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0084  tRNA-Thr  97.87 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  97.87 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  97.87 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  97.87 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0048  tRNA-Thr  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000535442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4505  tRNA-Thr  95.74 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000183891  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3120t  tRNA-Thr  95.74 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000534878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0003  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000427431  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0018  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000023441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4473  tRNA-Thr  95.74 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000034435  hitchhiker  0.00000000000000876352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4383  tRNA-Thr  95.74 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5441  tRNA-Thr  95.74 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000104819  hitchhiker  0.00042936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0030  tRNA-Lys  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.455261  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2719  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211587  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3123t  tRNA-Thr  95.74 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000529436  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1108t  tRNA-Thr  95.74 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3208t  tRNA-Thr  95.74 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3193t  tRNA-Thr  95.74 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0908668  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4548  tRNA-Thr  95.74 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000034857  hitchhiker  0.00000000000110779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>