272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0035 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0035  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0025  tRNA-Lys  96.43 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0024  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.330999  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0001  tRNA-Lys  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0037  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000296875  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0021  tRNA-Lys  93.22 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t36  tRNA-Lys  94.55 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0019  tRNA-Lys  93.22 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000484995  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0039  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0030  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0471674  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0044  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0696319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0037  tRNA-Lys  89.61 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000966044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0042  tRNA-Lys  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00104158  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0062  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.209249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0023  tRNA-Lys  92.59 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.489322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  90 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_722  tRNA-Lys  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0025  tRNA-Lys  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.48259e-19 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0023  tRNA-Lys  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.299591  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0013  tRNA-Lys  95.35 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882004  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0042  tRNA-Lys  95.35 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000336952  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0599  tRNA-Lys  90.91 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0048  tRNA-Lys  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.514987  normal  0.0153683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0026  tRNA-Lys  95.24 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000756326  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0031  tRNA-Lys  95.24 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0015  tRNA-Lys  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0792154  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0022  tRNA-Lys  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0023  tRNA-Lys  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0048  tRNA-Lys  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000334788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0044  tRNA-Lys  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0037  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0043  tRNA-Lys  95.12 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.438786  normal  0.486369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08800  tRNA-Lys  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0702581  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0019  tRNA-Lys  86.96 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0029  tRNA-Lys  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0030  tRNA-Lys  95.12 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.455261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0065  tRNA-Thr  88.33 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00709117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0110  tRNA-Thr  88.33 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  88.33 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0044  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0020  tRNA-Lys  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.255497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0079  tRNA-Thr  88.33 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0027  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0045  tRNA-Thr  88.33 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0076  tRNA-Thr  88.33 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0086  tRNA-Thr  88.33 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0034  tRNA-Lys  91.49 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0762298  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0050  tRNA-Lys  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0078  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0983786 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0028  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0022  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462625  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0039  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0040  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0030  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0025  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.949692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0026  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0027  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0021  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28780  tRNA-Lys  92.86 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.140061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0060  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00479449  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0061  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00229063  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0050  tRNA-Lys  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t26  tRNA-Lys  88.68 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0031  tRNA-Lys  92.68 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0058  tRNA-Lys  87.72 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0031  tRNA-Lys  88.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1295  tRNA-Lys  88.68 
 
 
78 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0020  tRNA-Lys  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.789057  hitchhiker  0.000213663 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.46 
 
 
73 bp  56  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00236112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4583  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0571835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0029  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0031  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199067  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0016  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0045  tRNA-Lys  87.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0045  tRNA-Lys  87.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0029  tRNA-Lys  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.395178  hitchhiker  0.000010783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0025  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445908  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15370  tRNA-Thr  90.91 
 
 
75 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00052169  normal  0.0383592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0023  tRNA-Lys  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.051511  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0047  tRNA-Lys  87.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0033  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.972639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0047  tRNA-Lys  87.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  90.7 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0030  tRNA-Lys  88.24 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00181999  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>