299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0037 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  97.92 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  97.92 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  89.19 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  89.19 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0043  tRNA-Lys  89.86 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0048  tRNA-Lys  89.86 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  92.98 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.047659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_778  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0001  tRNA-Lys  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.46268e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0031  tRNA-Lys  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0043  tRNA-Lys  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0051  tRNA-Thr  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124425  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0013  tRNA-Lys  89.39 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0036  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127196  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0019  tRNA-Lys  95.56 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000484995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0049  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000660852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0060  tRNA-Lys  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0021  tRNA-Lys  95.56 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0001  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000658326  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0093  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.8722200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0051  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0060  tRNA-Lys  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0073  tRNA-Lys  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000645959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  92.31 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0073  tRNA-Lys  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0053  tRNA-Lys  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  97.44 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0025  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0046  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195569  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0021  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0067  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0804329  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0084  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00872406  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0068  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2517  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00884396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2527  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2528  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0071  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0090  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2221  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2231  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243187  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2232  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  97.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  89.29 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0028  tRNA-Lys  91.67 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  89.29 
 
 
78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  89.29 
 
 
79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  89.29 
 
 
79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  89.29 
 
 
79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  89.29 
 
 
79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  89.29 
 
 
79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  89.29 
 
 
78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5728  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000897911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  89.29 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  89.29 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>